More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0603 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  100 
 
 
309 aa  633  1e-180  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  41.91 
 
 
311 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
314 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
314 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  45.31 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  41.25 
 
 
311 aa  252  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.78 
 
 
313 aa  250  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  44.08 
 
 
324 aa  249  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.45 
 
 
320 aa  248  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
314 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
325 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  40.52 
 
 
326 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
321 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  38.91 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
326 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
311 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  41.37 
 
 
319 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
312 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
317 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
311 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  41.06 
 
 
314 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  38.59 
 
 
324 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
321 aa  245  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  41.75 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.59 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  40.06 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  39.68 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
323 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  38.59 
 
 
324 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  38.61 
 
 
335 aa  241  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
361 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  38.8 
 
 
317 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
314 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  38.8 
 
 
317 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
320 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  41.85 
 
 
321 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  38.8 
 
 
317 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  38.8 
 
 
317 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  42.62 
 
 
325 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  38.89 
 
 
321 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
324 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  37.66 
 
 
317 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
324 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  40 
 
 
324 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  38.94 
 
 
332 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
314 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  41.91 
 
 
302 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  41.94 
 
 
310 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  38.06 
 
 
317 aa  237  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 
306 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
320 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  41.42 
 
 
324 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  38.85 
 
 
318 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  38.85 
 
 
316 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
310 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
315 aa  236  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  37.82 
 
 
317 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
321 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.28 
 
 
309 aa  235  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  37.82 
 
 
317 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  37.82 
 
 
317 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  38.92 
 
 
318 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  40.72 
 
 
321 aa  235  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  37.82 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  39.68 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.41 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  36.63 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  38.73 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  41.42 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  40.19 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  37.66 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  37.97 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  38.22 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
318 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  37.79 
 
 
332 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
322 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
313 aa  233  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  38.98 
 
 
315 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
313 aa  232  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  37.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
308 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.11 
 
 
333 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  39.14 
 
 
332 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  39.03 
 
 
318 aa  232  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  38.02 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  38.31 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>