More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0578 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 527 aa  1055    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  32.91 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  29.44 
 
 		 710 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 		 668 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.1 
 
 		 944 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  27.58 
 
 		 712 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.78 
 
 		 870 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  35.67 
 
 		 714 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 717 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  33.44 
 
 		 640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30.99 
 
 		 655 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  27.18 
 
 		 887 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  34.49 
 
 		 654 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  34.49 
 
 		 650 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  34.49 
 
 		 654 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 640 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  26.72 
 
 		 882 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  27.18 
 
 		 887 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  32.7 
 
 		 641 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 640 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 640 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  25.31 
 
 		 726 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  26.08 
 
 		 715 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.55 
 
 		 894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  35.02 
 
 		 640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.82 
 
 		 635 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  26.71 
 
 		 716 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  30.89 
 
 		 672 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 658 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  30.91 
 
 		 662 aa  127  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  32.81 
 
 		 805 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  30.49 
 
 		 649 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  26.57 
 
 		 712 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  27.27 
 
 		 696 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 675 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  28.53 
 
 		 711 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  27.07 
 
 		 696 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 744 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.9 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 660 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  31.72 
 
 		 630 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  30.67 
 
 		 686 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  30.7 
 
 		 781 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  27.19 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  30.99 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  24.86 
 
 		 1269 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  25.45 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  25.78 
 
 		 893 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  32.1 
 
 		 810 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  29.28 
 
 		 714 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  30.37 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  30.37 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  30.37 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.96 
 
 		 698 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  30.37 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.96 
 
 		 698 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  29.47 
 
 		 771 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  25.1 
 
 		 729 aa  120  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  26.57 
 
 		 721 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  29.47 
 
 		 777 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  26.68 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  25.93 
 
 		 915 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  30.03 
 
 		 706 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  28.53 
 
 		 987 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28.9 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  31.19 
 
 		 710 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 787 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  29.49 
 
 		 787 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  30.95 
 
 		 738 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  24.9 
 
 		 657 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  25.81 
 
 		 682 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  29.62 
 
 		 775 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 747 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  29.84 
 
 		 736 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  29.63 
 
 		 714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 745 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  28.64 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  31.48 
 
 		 697 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  27.92 
 
 		 704 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  30.5 
 
 		 703 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  24.21 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  30.72 
 
 		 694 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 681 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.32 
 
 		 572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  26.98 
 
 		 710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  26.64 
 
 		 745 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  31.45 
 
 		 636 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  29.56 
 
 		 710 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 		 719 aa  114  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  30.19 
 
 		 721 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  30.19 
 
 		 721 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  28.47 
 
 		 703 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  29.34 
 
 		 714 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 703 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 553 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  23.57 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  25.74 
 
 		 704 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>