More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0566 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 636 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 646 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 645 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 645 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 644 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 638 aa  656    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 583 aa  1209    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 643 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 659 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 648 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 636 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 636 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 636 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 644 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 638 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 644 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 649 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 644 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 614 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 644 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 582 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 582 aa  596  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  51.09 
 
 		 582 aa  598  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 639 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 581 aa  585  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 611 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 611 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 633 aa  578  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 643 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  48.39 
 
 		 684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 662 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 684 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 690 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  48.76 
 
 		 564 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 635 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 659 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 646 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 604 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 637 aa  561  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 638 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 666 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 658 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.66 
 
 		 676 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 659 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 677 aa  555  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 657 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 672 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 657 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 682 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 610 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 637 aa  557  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 648 aa  551  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 677 aa  554  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 657 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 642 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 669 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 659 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 633 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 669 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 675 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  45.53 
 
 		 676 aa  553  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 660 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 638 aa  548  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 701 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 647 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 654 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 635 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 648 aa  549  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 687 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 668 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 646 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 661 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 652 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 604 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 644 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 646 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 608 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>