More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0562 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 321 aa  649    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  41.99 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  36.95 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  36.81 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  39.03 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  35.69 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  38.7 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  41.7 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  37.43 
 
 		 1029 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.94 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.56 
 
 		 762 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  38.34 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  38.43 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.32 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  36.34 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  36.34 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.59 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.02 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  36.49 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  32.95 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  39.31 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.79 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.79 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  33.53 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  35.44 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  35.82 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.27 
 
 		 991 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.76 
 
 		 995 aa  192  6e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  36.04 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.73 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  37.25 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  36.14 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  32.92 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  34.22 
 
 		 347 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.92 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  35.35 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  37.67 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.81 
 
 		 735 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  38 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  35.58 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  35.25 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.4 
 
 		 849 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  35.24 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3107  protein-export membrane protein SecF  33.55 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  38.75 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  34.88 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.01 
 
 		 996 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  33.69 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  37.19 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.14 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  32.28 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 759 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  34.26 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  34.29 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  35.09 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  35.69 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  35.82 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  36.15 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  32.27 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  34.93 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  33.43 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.71 
 
 		 995 aa  179  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  32.63 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  32.63 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  32.63 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  34.9 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>