More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0548 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  350  7e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.08 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.84 
 
 
169 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.5 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.81 
 
 
163 aa  87.8  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  61.84 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.5 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.24 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.84 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.09 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.95 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.14 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.08 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.71 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.23 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  58.33 
 
 
79 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.71 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.69 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.78 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  51.39 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.63 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  58.33 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  49.44 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  72 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.34 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.39 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.67 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.43 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.2 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  35.03 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.35 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.26 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  48.72 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.17 
 
 
151 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.19 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.22 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  57.38 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.95 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  64.29 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  43.75 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  49.3 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  51.56 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  48.57 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  35.88 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  89.47 
 
 
48 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.43 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  55.74 
 
 
634 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.32 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.36 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  55.93 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  54.1 
 
 
567 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  47.37 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  57.89 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.17 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  41.49 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  58.33 
 
 
527 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.33 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  50 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  46.15 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  42.86 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  50.85 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  45.31 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  40.57 
 
 
548 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
121 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  45.31 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  36.59 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  36.59 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  36.59 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  52.94 
 
 
169 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  33.09 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  41.33 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  50 
 
 
141 aa  57.4  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.27 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.27 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  47.37 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  35.71 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  38.82 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  46.03 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.76 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  40.62 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  43.75 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>