More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0519 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
415 aa  835    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
419 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 
428 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 
434 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 
425 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 
425 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 
426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.1 
 
 
434 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
422 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
426 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.15 
 
 
425 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
416 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 
426 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.24 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.39 
 
 
422 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.53 
 
 
426 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 
423 aa  342  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.67 
 
 
425 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.67 
 
 
425 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 
422 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.43 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 
425 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.2 
 
 
422 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.29 
 
 
426 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
416 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.09 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.24 
 
 
425 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
428 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
429 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
430 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
429 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.54 
 
 
420 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
430 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 
423 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
425 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
429 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  43.57 
 
 
445 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
429 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
429 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
430 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.33 
 
 
424 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  44.36 
 
 
443 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 
423 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
429 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
426 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
429 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 
423 aa  332  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.94 
 
 
433 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 
423 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.3 
 
 
423 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.76 
 
 
428 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.3 
 
 
423 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.31 
 
 
435 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 
429 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
430 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
432 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 
428 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.8 
 
 
427 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
432 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
429 aa  330  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.95 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 
423 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.83 
 
 
414 aa  329  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
429 aa  328  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
429 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  44.15 
 
 
443 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.29 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.52 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.19 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.74 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.52 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.05 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.77 
 
 
428 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.44 
 
 
426 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  41.94 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  325  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
429 aa  325  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 
424 aa  325  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>