94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0455 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 
176 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 
83 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  39.19 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
110 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  46.15 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.68 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  40.68 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
100 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
89 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  26.63 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
97 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  38.46 
 
 
263 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  21.84 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 
327 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  21.84 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
97 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
97 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
87 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  37.74 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.04 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.96 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
94 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  37.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  37.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
178 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
178 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  39.62 
 
 
135 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
180 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
359 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.69 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.69 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.6 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 
114 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  38.33 
 
 
219 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 
105 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  21.51 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  34.57 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  36.9 
 
 
354 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 
113 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  31.25 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 
465 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  35.59 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1077  hypothetical protein  34.15 
 
 
84 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  32.81 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  31.82 
 
 
104 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 
388 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
104 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 
99 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 
130 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  42.86 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3148  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3193  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.324962  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  39.62 
 
 
233 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.87 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
198 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 
134 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 
183 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
79 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
179 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 
105 aa  41.6  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
134 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  29.85 
 
 
376 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
104 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 
90 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
77 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
111 aa  41.6  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 
64 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.87 
 
 
395 aa  41.6  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1039  hypothetical protein  42.31 
 
 
84 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
128 aa  41.6  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
108 aa  41.6  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>