More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0437 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
386 aa  799    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  61.14 
 
 
393 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  60.52 
 
 
407 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  60.26 
 
 
391 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.57 
 
 
400 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  59.11 
 
 
396 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  60.52 
 
 
388 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  58.44 
 
 
389 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  57.96 
 
 
384 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  59.48 
 
 
389 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  58.49 
 
 
404 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.7 
 
 
404 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  56.85 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  58.7 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  58.18 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  57.29 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  57.52 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  58.01 
 
 
400 aa  464  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  58.42 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  59.74 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  57.92 
 
 
400 aa  461  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  56.59 
 
 
391 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  57.44 
 
 
394 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.59 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  58.33 
 
 
400 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  56.99 
 
 
401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  54.57 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  56.99 
 
 
401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  53.79 
 
 
402 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  56.73 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  56.58 
 
 
404 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  53.11 
 
 
402 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  53 
 
 
387 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  52.34 
 
 
388 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  52.08 
 
 
387 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  53.26 
 
 
404 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  52.48 
 
 
388 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.26 
 
 
396 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  51.17 
 
 
410 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  52.59 
 
 
392 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
400 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  51.44 
 
 
394 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  51.7 
 
 
397 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.91 
 
 
394 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
398 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  51.05 
 
 
407 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  50 
 
 
407 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.35 
 
 
392 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
398 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  51.57 
 
 
382 aa  381  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.83 
 
 
399 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.26 
 
 
384 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50 
 
 
384 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.61 
 
 
382 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  51.17 
 
 
393 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 
388 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  51.81 
 
 
392 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.58 
 
 
398 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49.87 
 
 
396 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
396 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  50.39 
 
 
393 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  48.06 
 
 
398 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  48.06 
 
 
398 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  49.35 
 
 
390 aa  364  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  50.39 
 
 
404 aa  362  6e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  47.14 
 
 
414 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  48.3 
 
 
398 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 
402 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.15 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.23 
 
 
417 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.66 
 
 
394 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.92 
 
 
409 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  49.35 
 
 
396 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  47.94 
 
 
401 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  46.39 
 
 
404 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  46.23 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  48.12 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.26 
 
 
394 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.96 
 
 
386 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  46.61 
 
 
407 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  45.31 
 
 
388 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  47.16 
 
 
507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.69 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  46.51 
 
 
401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.49 
 
 
405 aa  336  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  45.71 
 
 
401 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  45.97 
 
 
398 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  46.13 
 
 
404 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
407 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
407 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  46.09 
 
 
407 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.17 
 
 
395 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  46.13 
 
 
404 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  45.83 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  45.31 
 
 
405 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  45.31 
 
 
407 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.31 
 
 
407 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  46.56 
 
 
394 aa  330  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>