More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0436 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.56 
 
 
280 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.41 
 
 
284 aa  294  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.41 
 
 
284 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.8 
 
 
286 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.98 
 
 
281 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.11 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  52.43 
 
 
285 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.06 
 
 
281 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.84 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.66 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.53 
 
 
309 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.86 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.67 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.98 
 
 
281 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.01 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  49.82 
 
 
291 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.82 
 
 
291 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.49 
 
 
288 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.51 
 
 
293 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.85 
 
 
278 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.99 
 
 
294 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.99 
 
 
294 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.42 
 
 
309 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.59 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  47.37 
 
 
312 aa  251  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.45 
 
 
298 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.73 
 
 
329 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.72 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.44 
 
 
291 aa  234  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.51 
 
 
344 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  36.71 
 
 
323 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  36.39 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  36.42 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  36.39 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  36.39 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  35.29 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  37.31 
 
 
333 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  37.04 
 
 
330 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.89 
 
 
329 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  35.02 
 
 
324 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  34.73 
 
 
331 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  33.53 
 
 
338 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 
203 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.83 
 
 
203 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.79 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.5 
 
 
203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  46.07 
 
 
203 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.64 
 
 
333 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.93 
 
 
203 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  42.93 
 
 
203 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.74 
 
 
200 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.14 
 
 
153 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.9 
 
 
328 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  58.33 
 
 
149 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  56.67 
 
 
125 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.12 
 
 
145 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  56.3 
 
 
144 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.47 
 
 
127 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  51.09 
 
 
173 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 
142 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50 
 
 
144 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.72 
 
 
207 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  53.54 
 
 
129 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55 
 
 
124 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.03 
 
 
150 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.5 
 
 
131 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  54.47 
 
 
123 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  43.9 
 
 
211 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.85 
 
 
138 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.5 
 
 
124 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  52.03 
 
 
132 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.69 
 
 
137 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.16 
 
 
132 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 
132 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.28 
 
 
134 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  52.5 
 
 
122 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.28 
 
 
128 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 
154 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.47 
 
 
135 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.69 
 
 
133 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 
139 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.82 
 
 
133 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  52.03 
 
 
128 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  53.28 
 
 
182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.82 
 
 
133 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  51.69 
 
 
129 aa  132  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  52.46 
 
 
138 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  51.22 
 
 
133 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
133 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  51.15 
 
 
143 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  50 
 
 
211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  50 
 
 
129 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.37 
 
 
142 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  52.5 
 
 
173 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  51.26 
 
 
143 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  54.92 
 
 
127 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  49.26 
 
 
137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  51.22 
 
 
128 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>