More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0392 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.38 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.65 
 
 
152 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.58 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.12 
 
 
147 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.88 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.38 
 
 
163 aa  91.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.75 
 
 
167 aa  90.9  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 
156 aa  90.9  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.71 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.64 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.64 
 
 
169 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.96 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 
154 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.32 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.86 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
158 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.71 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  63.38 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.67 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.77 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.11 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  61.43 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.13 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.84 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.72 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  57.97 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  60 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.57 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  56.76 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  42.2 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.79 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  55.26 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  67.92 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.66 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  55.41 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  63.33 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  68.85 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  54.29 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.45 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.94 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.24 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.88 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  89.74 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  50.67 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.5 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  63.79 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  50.67 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  46.07 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  46.24 
 
 
567 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  46.74 
 
 
527 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  45.95 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  46.67 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  46.74 
 
 
634 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  46.67 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  51.43 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  64.41 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  77.27 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  51.67 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.65 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  53.23 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  48.33 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  36.04 
 
 
124 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  51.47 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  75 
 
 
48 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  53.7 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.73 
 
 
141 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  45.07 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  44.09 
 
 
548 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  35.65 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  71.79 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  35.65 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  36.36 
 
 
129 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  35.29 
 
 
221 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.12 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.78 
 
 
124 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  40.98 
 
 
133 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  37.62 
 
 
130 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  44.26 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.67 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  45.76 
 
 
131 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  45.76 
 
 
131 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  37.88 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  43.06 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.98 
 
 
133 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  41.1 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  43.06 
 
 
177 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  41.18 
 
 
189 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  40.28 
 
 
138 aa  57.8  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  33.05 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.68 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  55.81 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>