More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0326 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  100 
 
 
369 aa  762    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.59 
 
 
392 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  40 
 
 
390 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  39.78 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  39.95 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  39.52 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  39.25 
 
 
391 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.41 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.41 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  39.25 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.71 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.71 
 
 
391 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.71 
 
 
391 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  39.73 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.57 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.77 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  38.46 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  39.25 
 
 
408 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.3 
 
 
371 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  36.39 
 
 
380 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  39.13 
 
 
390 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.8 
 
 
403 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.47 
 
 
388 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  37.74 
 
 
395 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.2 
 
 
390 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  38.01 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.93 
 
 
377 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  38.21 
 
 
374 aa  238  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.58 
 
 
373 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.83 
 
 
403 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.63 
 
 
373 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.83 
 
 
379 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.2 
 
 
373 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  38.32 
 
 
380 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.86 
 
 
389 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.83 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  36.51 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.27 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  36.1 
 
 
384 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  36.24 
 
 
386 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36.19 
 
 
433 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  38.98 
 
 
364 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.97 
 
 
369 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  35.58 
 
 
370 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.14 
 
 
388 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.39 
 
 
380 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.39 
 
 
382 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.01 
 
 
389 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.33 
 
 
378 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  37.4 
 
 
370 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.27 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.11 
 
 
375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.28 
 
 
395 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  34.42 
 
 
402 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.04 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  33.86 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.6 
 
 
406 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.93 
 
 
842 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.11 
 
 
379 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.86 
 
 
411 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  33.97 
 
 
851 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.69 
 
 
441 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  34.69 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  35.42 
 
 
811 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  39.24 
 
 
365 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  34.9 
 
 
399 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  32.45 
 
 
387 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  32.61 
 
 
421 aa  209  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.69 
 
 
376 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  36.34 
 
 
379 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  36.34 
 
 
379 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  32.96 
 
 
399 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  33.61 
 
 
399 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.79 
 
 
395 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  34.95 
 
 
384 aa  202  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.79 
 
 
395 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  33.42 
 
 
366 aa  202  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  38.58 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  37.6 
 
 
844 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  32.79 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  33.42 
 
 
371 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  32.35 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  34.68 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  34.76 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  31.42 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.41 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.41 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  31.98 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  35.42 
 
 
849 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.15 
 
 
369 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  31.46 
 
 
375 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.13 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  34.89 
 
 
372 aa  196  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0768995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>