More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0306 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  41.74 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  37.74 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  37.91 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  35.19 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  41.06 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  36.49 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  40.49 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  40.28 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.02 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>