More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0274 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50.96 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.79 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.82 
 
 
158 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.24 
 
 
155 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.25 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.51 
 
 
152 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.71 
 
 
147 aa  89.4  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.97 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  39.77 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.86 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.56 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.85 
 
 
157 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  66.2 
 
 
79 aa  84.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.47 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.65 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.67 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  46 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.86 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.25 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  55.7 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.15 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.43 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  57.33 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.85 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.9 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.73 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.22 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.53 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.28 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  57.14 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.28 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  46.48 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  52.86 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  62.96 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  55.71 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  54.84 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.87 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  51.76 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  52.11 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  53.62 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.52 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.86 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.83 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  52.24 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  43.06 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.32 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  62.96 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  48.39 
 
 
221 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  52.11 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.42 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.42 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  78.95 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  46.77 
 
 
548 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  40.74 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  49.15 
 
 
634 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  76.32 
 
 
48 aa  57.4  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  50.79 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  47.76 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  51.92 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  37.68 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.65 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  38.27 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
121 aa  55.1  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46.38 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46.38 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  53.19 
 
 
142 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  37.84 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  37.35 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  29.13 
 
 
138 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.06 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  44.64 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  46.67 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.33 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  45.61 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.91 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  38.6 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  42.37 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  46.15 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  41.82 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  50 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.75 
 
 
173 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  30.36 
 
 
177 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  30.36 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  50 
 
 
567 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  45.45 
 
 
130 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  50 
 
 
527 aa  51.6  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>