More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0267 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  100 
 
 
334 aa  670    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.5 
 
 
295 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.41 
 
 
301 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  43.67 
 
 
312 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  42.9 
 
 
295 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.24 
 
 
294 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  41.87 
 
 
307 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  42.64 
 
 
297 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  43.73 
 
 
297 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  42.99 
 
 
320 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.82 
 
 
294 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  40.96 
 
 
309 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  40.96 
 
 
309 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  41.28 
 
 
297 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  42.77 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  45.3 
 
 
297 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 
306 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.77 
 
 
309 aa  235  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.51 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 
299 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  42.22 
 
 
300 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 
295 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  40.48 
 
 
300 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  41.32 
 
 
300 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  42.6 
 
 
297 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  41.99 
 
 
297 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  42.3 
 
 
297 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.99 
 
 
295 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.76 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  41.39 
 
 
297 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 
297 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  41.39 
 
 
297 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  42.6 
 
 
296 aa  222  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  38.25 
 
 
337 aa  222  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  42.47 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.34 
 
 
327 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  40.06 
 
 
294 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.67 
 
 
290 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.33 
 
 
290 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  42.6 
 
 
296 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  42.26 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  39.22 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  39.25 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  42.26 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  212  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  43.56 
 
 
297 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  41.8 
 
 
297 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  38.37 
 
 
286 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.69 
 
 
296 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  39.33 
 
 
299 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  39.46 
 
 
294 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  37.62 
 
 
297 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  39.1 
 
 
287 aa  202  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 
290 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  37.54 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  37.13 
 
 
296 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  43.67 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  38.71 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  39.13 
 
 
315 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  40.12 
 
 
298 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.14 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.62 
 
 
306 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  38.81 
 
 
305 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  36.39 
 
 
297 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 
298 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  39.16 
 
 
294 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  35.82 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  39.34 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  38.71 
 
 
293 aa  188  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  35.07 
 
 
335 aa  188  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  42.14 
 
 
291 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 
290 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  38.86 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  38.02 
 
 
294 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  38.86 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 
292 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  38.86 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  36.61 
 
 
299 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  37.76 
 
 
293 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 
297 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  36.75 
 
 
311 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  36.16 
 
 
300 aa  185  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  36.44 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  37.46 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  40.54 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 
293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  37.66 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 
293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  37.66 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>