More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0265 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
166 aa  345  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.47 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  46.15 
 
 
158 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.96 
 
 
158 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.51 
 
 
159 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
169 aa  101  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  35.23 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
161 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.51 
 
 
151 aa  98.6  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.56 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.61 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.13 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.51 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.06 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.38 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.63 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  68.57 
 
 
79 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.51 
 
 
155 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.14 
 
 
152 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.01 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.14 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.49 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  64.29 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.47 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.7 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.86 
 
 
163 aa  87.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.12 
 
 
193 aa  87  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.71 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.97 
 
 
171 aa  84  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.1 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  61.54 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  39.38 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.89 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.46 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  53.76 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  33.53 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  61.64 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.65 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  55.13 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  36.36 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  34.71 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  68.33 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  57.14 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  46.15 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  45.1 
 
 
634 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  46.08 
 
 
527 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.46 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  34.78 
 
 
548 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  39.62 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  45.54 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  81.4 
 
 
48 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  55 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.35 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  30.32 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  34.71 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  31.76 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  51.02 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  47.83 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  30.56 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  57.14 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.76 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  60.42 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  60.42 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  45.59 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.67 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.75 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.03 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  44.44 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  44.44 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  58 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  31.2 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  58 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  53.85 
 
 
152 aa  57.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  45.45 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  46.03 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  35.64 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  38.1 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.49 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.49 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  55.81 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  33.08 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  39.44 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.16 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  48.89 
 
 
221 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  42.03 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  55.81 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>