163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0193 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0193  nuclease  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  44.85 
 
 
232 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42.96 
 
 
244 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  41.61 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  41.61 
 
 
221 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  41.77 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  45.59 
 
 
148 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  37.21 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.58 
 
 
175 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.94 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  35.33 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  39.55 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  39.33 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  41.73 
 
 
153 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  40.88 
 
 
156 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  42.22 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  41.98 
 
 
153 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  43.61 
 
 
150 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  41.13 
 
 
153 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.69 
 
 
153 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  35.81 
 
 
187 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  43.62 
 
 
175 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  39.44 
 
 
158 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  36.36 
 
 
169 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  40 
 
 
164 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.04 
 
 
238 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.03 
 
 
171 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.97 
 
 
193 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
227 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.62 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.96 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  40.43 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.87 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  37.57 
 
 
171 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.84 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  39.42 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.68 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.3 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  33.74 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  34.04 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.78 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.07 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  38.52 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 
228 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.33 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.81 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  39.72 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  34.07 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.01 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.9 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  36.09 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.09 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.31 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  37.58 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  28.79 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35.21 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.5 
 
 
233 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.64 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.79 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.33 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  31.67 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.19 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  28.48 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  33.81 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  33.33 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  33.81 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  33.81 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.74 
 
 
161 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
226 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  29.21 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  36.72 
 
 
240 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.16 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  28.25 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  28.25 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.33 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 
271 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.6 
 
 
226 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 
202 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  34.29 
 
 
185 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.16 
 
 
284 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  29.1 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  32.19 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.14 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.82 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  29.85 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  34.42 
 
 
534 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 
243 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>