More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0163 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
713 aa  1462    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.81 
 
 
646 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.94 
 
 
648 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.65 
 
 
648 aa  399  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 
797 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  33.15 
 
 
804 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.06 
 
 
806 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.19 
 
 
649 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 
833 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.24 
 
 
761 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 
643 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 
744 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 
643 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 
797 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 
654 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 
779 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 
661 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 
643 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
793 aa  369  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 
774 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  31.89 
 
 
799 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 
794 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 
701 aa  363  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  33.2 
 
 
755 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 
640 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.05 
 
 
667 aa  361  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.42 
 
 
640 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
618 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 
905 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 
662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
750 aa  356  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  33.71 
 
 
730 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.65 
 
 
765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  32.4 
 
 
752 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  32.43 
 
 
760 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 
712 aa  352  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.37 
 
 
704 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.98 
 
 
766 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
681 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.94 
 
 
824 aa  352  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 
796 aa  349  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.98 
 
 
693 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 
757 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.48 
 
 
751 aa  347  5e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  30.9 
 
 
799 aa  347  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  30.93 
 
 
791 aa  347  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  30.48 
 
 
804 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 
762 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  33.97 
 
 
890 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 
811 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.64 
 
 
761 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 
709 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 
709 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 
709 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 
799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 
625 aa  341  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  30.5 
 
 
799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  31.91 
 
 
774 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 
727 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
793 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 
641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.64 
 
 
683 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  30.89 
 
 
837 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.08 
 
 
707 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.76 
 
 
626 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  30.09 
 
 
838 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 
839 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
770 aa  334  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  30.27 
 
 
846 aa  334  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 
839 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  30.25 
 
 
839 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.71 
 
 
828 aa  333  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 
683 aa  333  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  31.77 
 
 
773 aa  333  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  33.8 
 
 
730 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 
705 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
714 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.24 
 
 
655 aa  331  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  33.64 
 
 
763 aa  331  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.39 
 
 
638 aa  330  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.79 
 
 
683 aa  330  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  31.73 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  31.73 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  31.73 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 
727 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 
713 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 
713 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 
713 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
714 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  32.49 
 
 
683 aa  328  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  32.49 
 
 
683 aa  327  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  32.34 
 
 
683 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  31.17 
 
 
656 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.91 
 
 
710 aa  324  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>