More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0122 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1073 aa  2149    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  40.91 
 
 
1062 aa  784    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  36.01 
 
 
1470 aa  625  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 
1036 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.5 
 
 
1496 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1071 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1028 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 
1055 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 
1028 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1028 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1032 aa  595  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 
1041 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 
1047 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 
1095 aa  589  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 
1038 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.06 
 
 
1070 aa  584  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1039 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.27 
 
 
1069 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 
1050 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1038 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1014 aa  558  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 
1075 aa  552  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 
1055 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 
1028 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1029 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.35 
 
 
1024 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 
1066 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1044 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 
1037 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 
1032 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1035 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1026 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.8 
 
 
1033 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.8 
 
 
1041 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 
1067 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.73 
 
 
1032 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 
1042 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 
1064 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 
1041 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 
1041 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 
1054 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1034 aa  522  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 
1033 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 
1058 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1031 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 
1037 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 
1058 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 
1054 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 
1030 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1048 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 
1037 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 
1054 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1040 aa  516  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 
1044 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 
1037 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 
1041 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1041 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 
1042 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 
1034 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1034 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 
1065 aa  512  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  30.93 
 
 
1068 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 
1031 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 
1031 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 
1031 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.02 
 
 
1031 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 
1034 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1031 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1051 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 
1022 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.64 
 
 
1034 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1031 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1031 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.04 
 
 
1028 aa  506  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 
1024 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 
1042 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1031 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 
1031 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 
1044 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 
1031 aa  505  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  32.16 
 
 
1030 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.7 
 
 
1040 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 
1022 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 
1032 aa  503  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 
1042 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1011 aa  502  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 
1033 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2138  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 
1047 aa  502  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.14514  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 
1033 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1009 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 
1029 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1063 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 
1032 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 
1037 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 
1034 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 
1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1035 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  31.47 
 
 
1026 aa  496  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 
1036 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 
1032 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>