253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0112 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
370 aa  755    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 
365 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.43 
 
 
362 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.07 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
360 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  27.46 
 
 
360 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.7 
 
 
392 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 
359 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.88 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 
359 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
359 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.62 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.78 
 
 
360 aa  93.6  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.14 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  26.44 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.71 
 
 
359 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 
423 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 
1153 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 
792 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.35 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 
1040 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  21.02 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.89 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 
1111 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  23.2 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  20.68 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.17 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.47 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.06 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.13 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 
1096 aa  73.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.93 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.27 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.38 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  19.94 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 
1061 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  22.87 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  21.64 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 
1061 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  22.53 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.34 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.82 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  21.07 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  19.39 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  22.81 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  19.14 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  22.81 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.93 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  18.44 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  18.44 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  24.46 
 
 
356 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  22.47 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.99 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.22 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  22.44 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  22.75 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.63 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  20.06 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  21.19 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  22.47 
 
 
383 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  21.67 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>