285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0070 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0070  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.623424  hitchhiker  0.00000000180064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  30.31 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  29.76 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25.84 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  28.32 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  27.74 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.38 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  29.33 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.52 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  26.04 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  29.95 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.46 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  35.19 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.24 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  30.15 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.47 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  21.75 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  23.29 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  23.29 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.43 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  23.05 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.59 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.19 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.19 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  27.73 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.19 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.65 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  23.76 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  25.79 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  25.79 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  25.97 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  24.14 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  25.79 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  25.79 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  22.48 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  22.48 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  27.3 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  29.5 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  23.29 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.78 
 
 
379 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  23.96 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  26.64 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  24.51 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.31 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  26.07 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  26.07 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  25.29 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.46 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.36 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  24.63 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  27.95 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  25.39 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  25.39 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  25.29 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.37 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  24.9 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  24.9 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  21.95 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  24.9 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.24 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  27.13 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  26.64 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  23.44 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  28.21 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  26.88 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
311 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  25.19 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  26.59 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  24.61 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  25.09 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  25.19 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>