More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0058 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0058  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
498 aa  1027    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.281197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
499 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
515 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
497 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
489 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
497 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
499 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
496 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
511 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
510 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
501 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
507 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
509 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
515 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
489 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
503 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
494 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
515 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
495 aa  428  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
494 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
501 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
505 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
495 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
496 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
494 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
494 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
498 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
488 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.74 
 
 
498 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
631 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
489 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
501 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
491 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  43.41 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
507 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
504 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
562 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
567 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
489 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
499 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
523 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
496 aa  415  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
573 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
578 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
499 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
514 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 
504 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
499 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
502 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
577 aa  411  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
501 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
499 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1078  lysyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0997  lysyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00135477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1117  lysyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.462738  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
496 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
492 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
502 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
573 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
509 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
492 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
492 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
501 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  41.58 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>