More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0057 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.8 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.12 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.42 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  57.69 
 
 
79 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  56 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.8 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  46.3 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.76 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.06 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.24 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.54 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.41 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.22 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.7 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  48.84 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.06 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.44 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.42 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  45.83 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  69.23 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.59 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.31 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.65 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.3 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.19 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.41 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  60.38 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.56 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.31 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  39.8 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  45.36 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.37 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.84 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  36.3 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.35 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  43.82 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  60.38 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  47.44 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.9 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  33.15 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  43.3 
 
 
527 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50.72 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.18 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  57.89 
 
 
634 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.81 
 
 
48 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  36.67 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  56.6 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  42.71 
 
 
567 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.22 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.79 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  54.9 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  40 
 
 
548 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  35.24 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.12 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  39.58 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  36.76 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  54.35 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  36.73 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  46.3 
 
 
140 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  41.94 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  46.15 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  42.19 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.44 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  52.94 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  39.71 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  44.64 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  41.82 
 
 
161 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  49.06 
 
 
135 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  42.86 
 
 
160 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  52.5 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  50 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  50 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  45.1 
 
 
196 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  44.83 
 
 
111 aa  51.2  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  52.83 
 
 
70 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  45 
 
 
199 aa  50.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  48.21 
 
 
133 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  35.14 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  41.67 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  43.75 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  44 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  37.84 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  50 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  44.83 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>