121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0025 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0025  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
445 aa  919    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
227 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
3145 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
505 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
565 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 
639 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  28.57 
 
 
563 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
718 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  29.57 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.01 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
601 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
934 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.07 
 
 
703 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
808 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.01 
 
 
632 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 
364 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
804 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
602 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
291 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.95 
 
 
1676 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  26.71 
 
 
1569 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 
616 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 
559 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  31.34 
 
 
929 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 
979 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
1737 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
762 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.17 
 
 
561 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
224 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
968 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
643 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
792 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
601 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
301 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3901  heat shock protein DnaJ domain protein  34.18 
 
 
341 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40165  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.61 
 
 
626 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  38.55 
 
 
837 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.17 
 
 
561 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.74 
 
 
546 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
605 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 
1154 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 
385 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.96 
 
 
681 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
200 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
717 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
594 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
3172 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
1069 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.11 
 
 
739 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0008  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.508518  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
563 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
527 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
670 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.59 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52971  anaphase-promoting complex component  27.4 
 
 
698 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
205 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
717 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
133 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
883 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.05 
 
 
883 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
700 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  25.34 
 
 
1588 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 
1087 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.26 
 
 
850 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
591 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.59 
 
 
545 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 
1050 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
1085 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30.99 
 
 
729 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
707 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
615 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.59 
 
 
725 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
767 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
581 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.96 
 
 
824 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 
586 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
366 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
2262 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
284 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 
786 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 
293 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.92 
 
 
554 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 
615 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.29 
 
 
810 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  34.48 
 
 
637 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
1333 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
290 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  25.2 
 
 
640 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>