51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0021 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  43.99 
 
 
807 aa  686    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  43.6 
 
 
814 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  41.92 
 
 
812 aa  679    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  43.86 
 
 
814 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
786 aa  1645    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 
811 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  41.81 
 
 
813 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 
820 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  43.36 
 
 
811 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 
811 aa  693    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 
807 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  42.99 
 
 
817 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
850 aa  635  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  40.84 
 
 
794 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
791 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  35.46 
 
 
823 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
871 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  39.03 
 
 
900 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  34.71 
 
 
816 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  34.83 
 
 
812 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  37.83 
 
 
812 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  35.23 
 
 
862 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  37.11 
 
 
907 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  37.7 
 
 
902 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  37.41 
 
 
790 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  46.46 
 
 
709 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 
779 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  39.74 
 
 
771 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  41.22 
 
 
821 aa  406  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  35.02 
 
 
766 aa  373  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  37.16 
 
 
682 aa  309  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 
485 aa  259  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 
485 aa  258  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.17 
 
 
472 aa  253  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  33.69 
 
 
471 aa  250  6e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 
609 aa  60.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25 
 
 
706 aa  56.6  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 
1162 aa  54.3  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
566 aa  51.6  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
584 aa  50.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.42 
 
 
686 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
1022 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  20.9 
 
 
1042 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 
606 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  22.8 
 
 
994 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
551 aa  45.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
732 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
1006 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
744 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  23.98 
 
 
744 aa  44.3  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  22.44 
 
 
743 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>