142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0018 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 485 aa  1012    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  36.65 
 
 		 492 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  38.98 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  34.7 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  37.78 
 
 		 497 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  34.84 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  34.84 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  36.46 
 
 		 513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  39.8 
 
 		 480 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  34.18 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  35.88 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  38.07 
 
 		 481 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  28.31 
 
 		 1153 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  27.03 
 
 		 1165 aa  167  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  27.85 
 
 		 1202 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  29.18 
 
 		 1181 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  27.37 
 
 		 1193 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 1214 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  26.94 
 
 		 1101 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  27.29 
 
 		 1231 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  27.71 
 
 		 1229 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  28.34 
 
 		 1118 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 1118 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 1128 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 1173 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  28.99 
 
 		 1177 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.39 
 
 		 1253 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  26.19 
 
 		 1144 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 		 1164 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 1186 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 		 1172 aa  144  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  25.86 
 
 		 1167 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  26.27 
 
 		 1201 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.13 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.82 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.21 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 758 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 687 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  24.03 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  23.92 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 579 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  22.59 
 
 		 728 aa  70.5  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  19.59 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  24.09 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  25.27 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  23.9 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.08 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  22.77 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  22.25 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  22.25 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  22.11 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  25.62 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.33 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  25.62 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  22.41 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  22.3 
 
 		 667 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  24.15 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  22.69 
 
 		 752 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 703 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  24.43 
 
 		 630 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  22.67 
 
 		 545 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  24.07 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 709 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 752 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  53.19 
 
 		 614 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  20.05 
 
 		 635 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  30.67 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  22.39 
 
 		 715 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  23.42 
 
 		 540 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  26.63 
 
 		 552 aa  47  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.83 
 
 		 623 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  22.05 
 
 		 590 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  22.19 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  23.65 
 
 		 709 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  22.34 
 
 		 736 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>