More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0016 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  100 
 
 
324 aa  664    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  39.53 
 
 
216 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  37.67 
 
 
216 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  42.08 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  38.89 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.19 
 
 
198 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.1 
 
 
225 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  39.62 
 
 
199 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.79 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  38.46 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  39.23 
 
 
199 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  38.92 
 
 
219 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  39.18 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.22 
 
 
221 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  38.53 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  37.44 
 
 
214 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  35.65 
 
 
219 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.21 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  36.21 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  36.21 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  36.21 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  36.21 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.07 
 
 
288 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.49 
 
 
297 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  31.45 
 
 
262 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  38.1 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  38.1 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  33.91 
 
 
269 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.4 
 
 
240 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  30.23 
 
 
270 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  36.63 
 
 
263 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.1 
 
 
322 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  32.79 
 
 
289 aa  125  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  33.2 
 
 
276 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  30.26 
 
 
279 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  31.69 
 
 
322 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  35.24 
 
 
264 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.27 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  32.46 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  32.77 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  33.5 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.33 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  36.49 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.68 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  29.36 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  31.89 
 
 
305 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.38 
 
 
299 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  36.79 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  33.8 
 
 
297 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  32.63 
 
 
305 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  32.63 
 
 
305 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  32.63 
 
 
305 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  32.56 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33 
 
 
267 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  32.56 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  30.08 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  31.3 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  35.85 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  32.46 
 
 
230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.06 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  33.33 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  30.93 
 
 
268 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.78 
 
 
297 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.78 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.77 
 
 
305 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  32.47 
 
 
230 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  29.74 
 
 
322 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  30.49 
 
 
275 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.18 
 
 
305 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  28.8 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  31.91 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  28.04 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  33.78 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  36.12 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  34.83 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  30.93 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  30.93 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  30.93 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  36.48 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  27.18 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  30.93 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.39 
 
 
266 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  36.7 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  33.33 
 
 
245 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  33.19 
 
 
268 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  33.94 
 
 
247 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  34.21 
 
 
238 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.25 
 
 
298 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  36.87 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.26 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.19 
 
 
171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  34.22 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>