66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0011 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  100 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  60.63 
 
 
126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  60.63 
 
 
126 aa  159  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
127 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
126 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  59.84 
 
 
126 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 
125 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  57.48 
 
 
126 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
124 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  55.91 
 
 
126 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
125 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  55.2 
 
 
125 aa  147  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 
124 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
126 aa  146  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  54.33 
 
 
126 aa  143  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  52.38 
 
 
126 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  51.97 
 
 
126 aa  141  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 
126 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  51.97 
 
 
126 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  51.52 
 
 
131 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  51.18 
 
 
126 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  49.61 
 
 
125 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  49.61 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  47.24 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 
126 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  40.65 
 
 
124 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  45.45 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.62 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.98 
 
 
126 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  44.83 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.86 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  42.15 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.94 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.22 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.89 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  30.09 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  37.37 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  36.84 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.02 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  46.81 
 
 
47 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.68 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  39.08 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.29 
 
 
42 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  54.55 
 
 
41 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  33 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  31.86 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45.95 
 
 
41 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.74 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  31.62 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.04 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  31.62 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  51.52 
 
 
41 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.58 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  54.29 
 
 
216 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  57.58 
 
 
39 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  53.12 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  53.12 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  53.12 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  50 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.24 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  35.63 
 
 
280 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  54.29 
 
 
214 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>