More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0003 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 369 aa  740    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  34.14 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.31 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.15 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.8 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  34.15 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 		 369 aa  212  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  32.43 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  31 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.27 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.08 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.89 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  32.88 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  30.81 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.22 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.62 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.27 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.45 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.17 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  32.02 
 
 		 378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.19 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.98 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000008266  decreased coverage  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.12 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.03 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.99 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.46 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  31.27 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03584  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000276402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  31.08 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3914  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000199842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5129  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000402669  normal  0.135624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4211  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0647653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03528  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4224  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000133889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4066  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0145467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 		 366 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  31 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  32.27 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  31.99 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0033  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234864  normal  0.233091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.27 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000790466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.61 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.4 
 
 		 372 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  31.27 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.27 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  29.76 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4152  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.03 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4176  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000208549  normal  0.014688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.54 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.18 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.33 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.05 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000030299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.17 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.54 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.17 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  32.17 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  31.38 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.19 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>