121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0031 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  89.39 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0014  tRNA-His  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0346111  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13120  tRNA-His  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100259  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0016  tRNA-His  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0044  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02876  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313769  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0031  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0014  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0055  tRNA-Pro  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt35  tRNA-His  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-His-3  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0022  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.182348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1995  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180123  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2495  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.374126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0023  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0032  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00257148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0037  tRNA-His  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000665099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0047  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0045  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0639484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0018  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901161  normal  0.123364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0036  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420238  normal  0.0855626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1715  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0031  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0048  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0372  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1828  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1842  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0661069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0789  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0039  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000465225  normal  0.429599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0047  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000286041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0047  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0055  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.337308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0008  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.958243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0023  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0041  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0057  tRNA-His  84.62 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  83.56 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  83.56 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0055  tRNA-His  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0053  tRNA-His  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0045  tRNA-His  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000264916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0090  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0024  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0036  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0370477  normal  0.249392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0035  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0069  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000556793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0088  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0024  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.961461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0096  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000270279  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0056  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441531  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0058  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  hitchhiker  0.000424792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0002  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4200  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0045  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0046  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0526  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000639476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0064  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0431987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0043  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>