34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3123 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  100 
 
 
108 aa  226  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  60 
 
 
112 aa  130  9e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.38 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29.29 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  28.85 
 
 
111 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  32.94 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.04 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.85 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  34.88 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  26.61 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  37.88 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  35.94 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  26.36 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  32.93 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  28.75 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  26.42 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  32.93 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  33.8 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  26.42 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 
137 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  22.22 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  31.75 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 
80 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
130 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  39.06 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>