More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3116 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  68.6 
 
 		 401 aa  362  3e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  66.93 
 
 		 422 aa  343  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  50.79 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  42.41 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  44.49 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.59 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  44.23 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.92 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.8 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.41 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  43.92 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.24 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  46.03 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  41.67 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  44.14 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  45.56 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.37 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.11 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  41.8 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  40.64 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.14 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  41.41 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  41.41 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  41.11 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.25 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  39.93 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  39.35 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  43.87 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.77 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.69 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  42.15 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  40.5 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.73 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  38.52 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  43.58 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.52 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  43.19 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  43.19 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.5 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  47.6 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  41.26 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.92 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  38.37 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  39.39 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.54 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.62 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  41.83 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  40.47 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.15 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.84 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.76 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  40.08 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.08 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.61 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.84 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  41.09 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.69 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  39.69 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.92 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  39.69 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 314 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  38.74 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  41.34 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  38.61 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  39.92 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  40.08 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.16 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40.77 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.69 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  39.38 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  39 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.55 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  38.11 
 
 		 377 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  38.3 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.19 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  38.89 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 424 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  42.06 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  38.06 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  37.68 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.16 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  40.7 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  38.76 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>