17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3082 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3082  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  36.92 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  35 
 
 		 70 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0127  DNA-binding protein  33.8 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.797375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 197 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  29.51 
 
 		 383 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>