158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2981 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
312 aa  640  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  45.08 
 
 
320 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  47.31 
 
 
261 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.09596e-07  hitchhiker  2.9e-14 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  38.13 
 
 
362 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.09 
 
 
338 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
395 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 
208 aa  73.9  3e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.56006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.06 
 
 
149 aa  72.8  8e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.77 
 
 
149 aa  72  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.04 
 
 
149 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
149 aa  70.1  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.04 
 
 
92 aa  69.7  6e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  69.7  6e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  41.77 
 
 
149 aa  69.3  7e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.77 
 
 
149 aa  68.9  9e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.79 
 
 
186 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 
273 aa  67.8  2e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.46 
 
 
142 aa  66.6  5e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
134 aa  65.9  8e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  65.9  9e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  44.62 
 
 
143 aa  63.5  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  41.54 
 
 
200 aa  63.2  6e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
107 aa  62.8  8e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 
196 aa  62.4  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0134e-07 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 
194 aa  62.4  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
142 aa  61.6  2e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
189 aa  61.2  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 
189 aa  61.2  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.27 
 
 
436 aa  60.8  3e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  44.64 
 
 
197 aa  60.5  4e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
268 aa  60.1  5e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.6802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  45 
 
 
459 aa  60.1  5e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  29.35 
 
 
328 aa  58.9  9e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 
189 aa  58.9  9e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  25.88 
 
 
327 aa  58.5  1e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
192 aa  58.5  1e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 
205 aa  55.8  9e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
206 aa  55.5  1e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
204 aa  55.1  2e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.51 
 
 
262 aa  54.7  2e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 
262 aa  54.3  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 
364 aa  55.1  2e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
334 aa  54.3  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
262 aa  54.7  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  36.92 
 
 
101 aa  54.3  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  36.92 
 
 
101 aa  54.3  3e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  42.86 
 
 
293 aa  53.9  3e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.39653e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 
262 aa  54.3  3e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
322 aa  53.9  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  36.92 
 
 
101 aa  54.3  3e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 
123 aa  53.5  4e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
118 aa  53.1  5e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
197 aa  53.1  6e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
115 aa  53.1  6e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.83783e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
176 aa  52.8  7e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 
380 aa  52.8  7e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  52.8  8e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  52.8  8e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  52.8  8e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 
369 aa  52  1e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
185 aa  51.2  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  40.38 
 
 
374 aa  51.6  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
279 aa  50.8  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
115 aa  50.1  4e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 
125 aa  50.1  5e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
380 aa  50.1  5e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
231 aa  50.1  5e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  40.32 
 
 
296 aa  50.1  5e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.46 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  38.46 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 
72 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  2.37472e-07 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
135 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
115 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
115 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  26.61 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
117 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 
128 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  31.25 
 
 
252 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 
183 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  37.5 
 
 
209 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
152 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 
185 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
242 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 
197 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
104 aa  46.2  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
137 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.67 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
72 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
133 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>