More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2904 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.95 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 258 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 255 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.77 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  32.76 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>