More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2747 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  59.38 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 126 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 125 aa  88.6  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  53.25 
 
 		 128 aa  87.8  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  50.6 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 507 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 506 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 506 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 506 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 509 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  51.9 
 
 		 507 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  49.41 
 
 		 507 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 507 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 507 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  46.84 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.43 
 
 		 593 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  46.34 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 506 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.76 
 
 		 509 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 506 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 506 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  40.66 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  33.03 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  45.24 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.94 
 
 		 515 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  43.21 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 513 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  48.68 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  48.1 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 521 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  43.02 
 
 		 115 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  44.58 
 
 		 117 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  45 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 499 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 		 468 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 470 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.78 
 
 		 474 aa  63.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  43.06 
 
 		 478 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  44.58 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  39 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.55 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 520 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 		 477 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>