More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2549 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  100 
 
 
189 aa  377  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  49.72 
 
 
185 aa  185  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  52.33 
 
 
188 aa  173  2e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07850  shikimate kinase  40.46 
 
 
177 aa  124  8e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0207717 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  36.59 
 
 
176 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  41.95 
 
 
192 aa  119  4e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.42 
 
 
176 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  38.69 
 
 
170 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  42.44 
 
 
229 aa  117  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  42.69 
 
 
190 aa  117  1e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  40.48 
 
 
169 aa  116  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  41.07 
 
 
170 aa  115  4e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.37 
 
 
176 aa  114  7e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  41.57 
 
 
168 aa  114  7e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  38.51 
 
 
182 aa  114  7e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  41.07 
 
 
170 aa  114  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  39.77 
 
 
183 aa  113  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.58 
 
 
165 aa  114  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  42.76 
 
 
181 aa  114  1e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  41.07 
 
 
183 aa  112  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  41.18 
 
 
184 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  40 
 
 
179 aa  113  2e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  39.05 
 
 
174 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  40.61 
 
 
179 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  40 
 
 
184 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  34.52 
 
 
170 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  39.29 
 
 
172 aa  112  4e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  39.77 
 
 
183 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  35.37 
 
 
165 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  35.58 
 
 
165 aa  111  8e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.71 
 
 
174 aa  111  8e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.84461e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  35.58 
 
 
165 aa  111  8e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.97 
 
 
165 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  34.76 
 
 
165 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  7.16125e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.8278e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  38.79 
 
 
171 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.02686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  5.04262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  110  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  7.52096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  1e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.16276e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  110  1e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.4395e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  110  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  37.11 
 
 
172 aa  110  1e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  40.96 
 
 
177 aa  110  1e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.97 
 
 
165 aa  110  1e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  34.97 
 
 
165 aa  109  2e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  110  2e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  38.27 
 
 
182 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  38.82 
 
 
199 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  38.82 
 
 
184 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.2 
 
 
167 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  38.82 
 
 
209 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  38.12 
 
 
190 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  35.62 
 
 
165 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  38.82 
 
 
184 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  38.32 
 
 
173 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  38.1 
 
 
183 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  2.52706e-08 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  38.82 
 
 
177 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.37 
 
 
173 aa  108  7e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  38.82 
 
 
177 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  38.82 
 
 
177 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  38.82 
 
 
177 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  38.82 
 
 
177 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  40.27 
 
 
199 aa  108  7e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  40.61 
 
 
206 aa  107  8e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.06668e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  40.85 
 
 
173 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.04187e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.93059e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  37.13 
 
 
173 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  37.13 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.63169e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  37.13 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  5.28588e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  37.13 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.38429e-10  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  36.31 
 
 
173 aa  106  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  39.46 
 
 
186 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  36.26 
 
 
182 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  6.85723e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  37.8 
 
 
183 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  34.13 
 
 
199 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  40.61 
 
 
196 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  38.1 
 
 
179 aa  104  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  33.73 
 
 
165 aa  104  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  40.14 
 
 
180 aa  104  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  42.95 
 
 
191 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  36.65 
 
 
171 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  33.73 
 
 
165 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  39.63 
 
 
179 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  44.07 
 
 
190 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  40.24 
 
 
179 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  33.72 
 
 
185 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  36.36 
 
 
172 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  33.53 
 
 
185 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  35.9 
 
 
180 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  35.9 
 
 
180 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  36.81 
 
 
192 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  34.34 
 
 
171 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  35.06 
 
 
163 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>