More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2525 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  51.79 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  55.05 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2171  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0143808  normal  0.0847561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.89 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  50.89 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>