More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2316 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  92  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  25.97 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  22.39 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  64.29 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  39.29 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.1 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 332 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>