246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2281 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  100 
 
 		 928 aa  1909    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  38.36 
 
 		 922 aa  571  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  37.74 
 
 		 916 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  36.36 
 
 		 932 aa  547  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  30.17 
 
 		 925 aa  422  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  36 
 
 		 914 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 758 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  34.47 
 
 		 904 aa  351  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  25.44 
 
 		 1002 aa  151  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.83 
 
 		 1203 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 1196 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  32.56 
 
 		 629 aa  108  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.16 
 
 		 900 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.85 
 
 		 907 aa  105  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.08 
 
 		 903 aa  105  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  27.16 
 
 		 2204 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  32.12 
 
 		 934 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.29 
 
 		 1121 aa  97.8  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.83 
 
 		 902 aa  95.1  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.37 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  27.37 
 
 		 650 aa  92  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  26.39 
 
 		 2198 aa  91.3  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.69 
 
 		 606 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.45 
 
 		 986 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.81 
 
 		 643 aa  89  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  22.28 
 
 		 914 aa  89.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  27.48 
 
 		 905 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.9 
 
 		 2016 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.33 
 
 		 902 aa  87.8  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.82 
 
 		 946 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  29.55 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  26.09 
 
 		 2197 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  28.45 
 
 		 905 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  28.41 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  28.41 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.56 
 
 		 901 aa  84.3  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.08 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.33 
 
 		 2013 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.02 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  23.72 
 
 		 1041 aa  82.4  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.26 
 
 		 1980 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1062 aa  81.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.76 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.43 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.93 
 
 		 1523 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.04 
 
 		 633 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.06 
 
 		 1408 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  27.8 
 
 		 1132 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  26.81 
 
 		 2222 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.69 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.24 
 
 		 1090 aa  79.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  22.61 
 
 		 1622 aa  79  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.74 
 
 		 908 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.58 
 
 		 752 aa  77  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.83 
 
 		 1185 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.62 
 
 		 754 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.18 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.36 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.8 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1116 aa  75.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.71 
 
 		 1853 aa  75.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  25.49 
 
 		 975 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.53 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1126 aa  75.1  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  28.09 
 
 		 1077 aa  75.1  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.66 
 
 		 1099 aa  75.1  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1724 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  25.35 
 
 		 2207 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  25.66 
 
 		 1803 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  24.06 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.12 
 
 		 1973 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.91 
 
 		 1082 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.16 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.85 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.39 
 
 		 1048 aa  72.4  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  26.86 
 
 		 1171 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.4 
 
 		 1959 aa  71.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.74 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.48 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 958 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 		 1178 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  24.13 
 
 		 655 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  24.4 
 
 		 1958 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  23.66 
 
 		 1593 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1172 aa  70.1  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.87 
 
 		 635 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.32 
 
 		 1038 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.39 
 
 		 1877 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.67 
 
 		 1986 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1823 aa  67.8  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.86 
 
 		 1280 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.66 
 
 		 1861 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1176 aa  67.8  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.08 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  28.3 
 
 		 1157 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  27.55 
 
 		 1754 aa  67.4  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  27.42 
 
 		 1983 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  22.39 
 
 		 1620 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.59 
 
 		 479 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>