More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2239 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  75.64 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  75.66 
 
 
155 aa  238  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 
161 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  52.98 
 
 
157 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  52.74 
 
 
156 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
161 aa  133  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  51.66 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  48.23 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  50.34 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 
155 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  48.98 
 
 
158 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  51.7 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  51.7 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  50.34 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 
158 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 
158 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  52.2 
 
 
158 aa  123  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
175 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 
157 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
156 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  48.95 
 
 
163 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 
157 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  46.48 
 
 
175 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
162 aa  120  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  45.77 
 
 
175 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  48.2 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  46.76 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  44.16 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  48.94 
 
 
160 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 
158 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  50.38 
 
 
159 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
159 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  46.76 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 
163 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 
160 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  44.97 
 
 
159 aa  104  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  40.88 
 
 
159 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 
156 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.83 
 
 
158 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.5 
 
 
158 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
158 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
158 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 
164 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 
167 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  42.36 
 
 
157 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 
159 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  40.82 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  43.88 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  44.29 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  42.18 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 
176 aa  97.8  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  42 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  42.55 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  39.46 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  40.54 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 
160 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  40.82 
 
 
157 aa  94  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  40.43 
 
 
161 aa  93.6  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 
166 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>