More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2171 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  90.71 
 
 
140 aa  259  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  86.43 
 
 
143 aa  249  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  77.37 
 
 
145 aa  222  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  80 
 
 
141 aa  221  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 
145 aa  216  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  75 
 
 
144 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  73.57 
 
 
141 aa  214  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  77.04 
 
 
145 aa  213  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  72.14 
 
 
145 aa  213  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 
147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 
144 aa  209  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  71.43 
 
 
144 aa  208  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  208  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 
138 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  72.14 
 
 
144 aa  207  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  70.07 
 
 
138 aa  206  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  69.29 
 
 
144 aa  206  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  75.37 
 
 
145 aa  206  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 
144 aa  205  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  69.34 
 
 
137 aa  204  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
139 aa  204  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 
144 aa  204  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
139 aa  204  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  72.59 
 
 
145 aa  203  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 
139 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 
139 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  70.37 
 
 
139 aa  200  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  71.94 
 
 
139 aa  200  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  71.94 
 
 
139 aa  200  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  72.39 
 
 
138 aa  200  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  71.11 
 
 
151 aa  199  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  71.11 
 
 
138 aa  199  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  70.9 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
138 aa  197  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
138 aa  197  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6607  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  197  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  69.12 
 
 
139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  67.15 
 
 
138 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 
139 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 
144 aa  197  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 
144 aa  197  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 
138 aa  196  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  71.64 
 
 
144 aa  196  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  73.38 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 
139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  66.91 
 
 
139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
140 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  67.41 
 
 
139 aa  194  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  68.38 
 
 
139 aa  194  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 
143 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 
144 aa  193  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  65.25 
 
 
142 aa  193  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
139 aa  193  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 
137 aa  193  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 
139 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 
139 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
142 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 
143 aa  191  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 
142 aa  191  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 
142 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04050  LSU ribosomal protein L16P  65.19 
 
 
139 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 
145 aa  191  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
137 aa  191  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
139 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 
137 aa  190  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1130  ribosomal protein L16  65.19 
 
 
139 aa  190  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 
139 aa  190  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 
140 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 
140 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  65 
 
 
144 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  66.42 
 
 
138 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  65.19 
 
 
138 aa  188  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
137 aa  188  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1047  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
138 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.962938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1020  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
138 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 
151 aa  188  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1037  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
138 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688868  normal  0.447674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10722  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
138 aa  188  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.567895  normal  0.164294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1312  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0695  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
138 aa  187  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 
140 aa  187  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>