More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2060 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 547 aa  1116    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  59.16 
 
 		 544 aa  656    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  61.54 
 
 		 542 aa  656    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.69 
 
 		 553 aa  241  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 556 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.12 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 556 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.25 
 
 		 560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 583 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 		 603 aa  214  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.21 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 553 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.46 
 
 		 560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.8 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 543 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.01 
 
 		 542 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.07 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.59 
 
 		 606 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 583 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.34 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  28.95 
 
 		 560 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 569 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.75 
 
 		 574 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 543 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.85 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 619 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  31.13 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.17 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 616 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 569 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.91 
 
 		 563 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  29.52 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  33.28 
 
 		 550 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.05 
 
 		 582 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 550 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.87 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 579 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.32 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 533 aa  174  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 555 aa  173  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  30.14 
 
 		 575 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 601 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.62 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 596 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  29.02 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.89 
 
 		 543 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.55 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.35 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.22 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.32 
 
 		 522 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  29.88 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.78 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 573 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 613 aa  161  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.41 
 
 		 522 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.65 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 538 aa  160  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.94 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.39 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.86 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.86 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.13 
 
 		 540 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 548 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.17 
 
 		 522 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.86 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.68 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.39 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 557 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.32 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>