More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2012 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2012  ribosomal protein L27  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  79.75 
 
 		 84 aa  134  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  77.22 
 
 		 84 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  79.71 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  78.26 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  64.56 
 
 		 92 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 94 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  68.35 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  73.91 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  64.56 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1221  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  64.56 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 82 aa  100  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  64.56 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  64.56 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  71.62 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  69.57 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  59.49 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 100 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.76 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>