More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1991 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
156 aa  313  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  70.15 
 
 
161 aa  191  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
154 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
148 aa  101  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
220 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
152 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
220 aa  72  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  35.78 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  28.44 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
191 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.58 
 
 
325 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  30.89 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 
150 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>