60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1975 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  51.83 
 
 
222 aa  259  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  51.6 
 
 
225 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  52.05 
 
 
223 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  53 
 
 
222 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.49 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  49.77 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  45 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  46.58 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.87 
 
 
214 aa  184  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  42.92 
 
 
210 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 
214 aa  174  9e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  42.25 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  45.05 
 
 
255 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.06 
 
 
216 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  40.55 
 
 
218 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  42.72 
 
 
209 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  43.4 
 
 
199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.45 
 
 
212 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.84 
 
 
228 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.15 
 
 
218 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  40.87 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.7 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.69 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  35.92 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  35.02 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.11 
 
 
211 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  30.5 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  34.5 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.97 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32 
 
 
196 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.33 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.22 
 
 
212 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.44 
 
 
212 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  31.86 
 
 
200 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.4 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  33.67 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  29 
 
 
196 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  29 
 
 
196 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.71 
 
 
553 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.96 
 
 
544 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.7 
 
 
598 aa  87  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.49 
 
 
190 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.35 
 
 
545 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  27.14 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.05 
 
 
550 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.41 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.72 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.09 
 
 
570 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 
594 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.93 
 
 
559 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.61 
 
 
558 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.18 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  26.89 
 
 
333 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.89 
 
 
580 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.59 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.47 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>