43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1958 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
498 aa  1011    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.82 
 
 
492 aa  551  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.68 
 
 
552 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  39.8 
 
 
521 aa  377  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  41.48 
 
 
514 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.93 
 
 
559 aa  290  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.05 
 
 
470 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  25.05 
 
 
464 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  24.51 
 
 
482 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  24.51 
 
 
481 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  24.58 
 
 
481 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  24.95 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  24.22 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  24.51 
 
 
482 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  24.51 
 
 
481 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  24.01 
 
 
481 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  24.51 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  24.55 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  25.71 
 
 
417 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.58 
 
 
866 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  21.57 
 
 
605 aa  68.2  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  22.24 
 
 
507 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.09 
 
 
177 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  23.45 
 
 
574 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.51 
 
 
370 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.56 
 
 
171 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.81 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.76 
 
 
628 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  34.38 
 
 
361 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.46 
 
 
170 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  22.59 
 
 
531 aa  47  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.48 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2614  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.91 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000221676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
398 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  25.56 
 
 
575 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  26.87 
 
 
568 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.1 
 
 
264 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  30.47 
 
 
330 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.8 
 
 
413 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.1 
 
 
257 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.22 
 
 
374 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>