More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1929 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  100 
 
 
501 aa  1008    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  53.55 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  40.09 
 
 
554 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  35.27 
 
 
474 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.15 
 
 
429 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.43 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  27.41 
 
 
461 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.83 
 
 
446 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.88 
 
 
435 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.88 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  28.54 
 
 
432 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.31 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  29.97 
 
 
427 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.38 
 
 
428 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  29.95 
 
 
425 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.9 
 
 
438 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.29 
 
 
425 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.77 
 
 
433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.77 
 
 
433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.68 
 
 
425 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  28.13 
 
 
458 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.26 
 
 
488 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  29.17 
 
 
478 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.24 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.8 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.8 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  26.39 
 
 
435 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  27.92 
 
 
481 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.25 
 
 
454 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.77 
 
 
428 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  29.71 
 
 
471 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  27.46 
 
 
513 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  29.9 
 
 
446 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  28.84 
 
 
428 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  27.05 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.6 
 
 
435 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.05 
 
 
448 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  27.18 
 
 
479 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.53 
 
 
428 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  26.67 
 
 
478 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  26.67 
 
 
482 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  26.67 
 
 
478 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  27.31 
 
 
452 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.5 
 
 
433 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.51 
 
 
435 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  26.85 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.44 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  27.44 
 
 
463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  27.13 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  26.14 
 
 
468 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.78 
 
 
428 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  25.9 
 
 
432 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.42 
 
 
437 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  27.6 
 
 
481 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  26.68 
 
 
450 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  28.37 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  27.66 
 
 
428 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  26.85 
 
 
466 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.66 
 
 
428 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  26.32 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  26.71 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.97 
 
 
500 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  25.97 
 
 
463 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.95 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  26.09 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  27.14 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  25.28 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.14 
 
 
427 aa  128  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  25.52 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.42 
 
 
436 aa  127  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  26.68 
 
 
460 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  25.06 
 
 
438 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  24.42 
 
 
435 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  26.72 
 
 
470 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  25.85 
 
 
448 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  26.48 
 
 
439 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.02 
 
 
435 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  28.79 
 
 
448 aa  124  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  26.29 
 
 
454 aa  123  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  22.92 
 
 
431 aa  123  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  26.14 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  25.59 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  26.67 
 
 
447 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.09 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  24.78 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.98 
 
 
427 aa  120  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  24.38 
 
 
452 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  28.21 
 
 
432 aa  120  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  25.88 
 
 
443 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  24.6 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  26.53 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.39 
 
 
433 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  29.8 
 
 
513 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  26.92 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  25.69 
 
 
403 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>