More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1895 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2967  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000624507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3269  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.492047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 137 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 126 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 128 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 131 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  33.64 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  31 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 117 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 183 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  32.87 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 449 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 340 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.68 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  30.48 
 
 		 132 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 289 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  34.74 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.94 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  32.65 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  37.04 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  26.42 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.68 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 128 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  35.19 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 391 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  32.26 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.26 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  32.38 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  32.26 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  32.26 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  32.26 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.26 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 97 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>