More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1803 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1803  diguanylate cyclase  100 
 
 
519 aa  1046    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00715144  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor  39.02 
 
 
1375 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  39.44 
 
 
882 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3265  GGDEF domain-containing protein  36.41 
 
 
862 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00136665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4871  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 
684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1509  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.93 
 
 
571 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44121  normal  0.0349148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  36.97 
 
 
627 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.2 
 
 
761 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.2 
 
 
1665 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.41 
 
 
867 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  37.87 
 
 
710 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  37.42 
 
 
808 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1116  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.75 
 
 
494 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.464201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.02 
 
 
935 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.41 
 
 
935 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  40.51 
 
 
923 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2757  GGDEF domain/EAL domain protein  34.52 
 
 
703 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.04 
 
 
687 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.25746  normal  0.789676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1366  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.84 
 
 
738 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  32.03 
 
 
622 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.38 
 
 
562 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629722  normal  0.285223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2258  sensory box protein  39.38 
 
 
562 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202787  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2223  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.04 
 
 
725 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.847933  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3905  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.79 
 
 
893 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.801054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.97 
 
 
696 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.97 
 
 
696 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3110  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.76 
 
 
347 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.88 
 
 
902 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.769639  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3792  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.79 
 
 
893 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.88 
 
 
887 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.221023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2486  GGDEF  37.87 
 
 
703 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.07 
 
 
714 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  35.29 
 
 
1063 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.98 
 
 
754 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.48 
 
 
659 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.48 
 
 
659 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1071  membrane associated GGDEF protein  34.91 
 
 
525 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44470  transmembrane sensor cyclic di-GMP signal transduction protein  35.19 
 
 
513 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0322  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.37 
 
 
1481 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0210085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.81 
 
 
781 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0536  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  37.01 
 
 
829 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.26 
 
 
751 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  39.13 
 
 
1003 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  29.05 
 
 
610 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.92 
 
 
537 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369823  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2937  signal transduction protein  36.88 
 
 
1141 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  34.11 
 
 
990 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1239  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.64 
 
 
810 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0849983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  32.02 
 
 
601 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  34.11 
 
 
990 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2589  hypothetical protein  35.33 
 
 
759 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.04 
 
 
499 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  28.3 
 
 
631 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3287  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.13 
 
 
1003 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4439  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.24 
 
 
657 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1889  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.75 
 
 
562 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.969395  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.43 
 
 
820 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0661  signal transduction protein  36.97 
 
 
1006 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.71 
 
 
682 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3664  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.34 
 
 
759 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
955 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1829  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.05 
 
 
754 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000110456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  35.33 
 
 
715 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02533  putative diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2 (EAL)  36.09 
 
 
573 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0197  diguanylate cyclase  32.73 
 
 
507 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.24 
 
 
860 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.57 
 
 
716 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486546  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1312  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.25 
 
 
776 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  29.41 
 
 
628 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.07 
 
 
891 aa  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
319 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.14 
 
 
772 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  33.33 
 
 
873 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3081  sensory box protein/response regulator  38.18 
 
 
710 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.789878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  35.37 
 
 
884 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.36 
 
 
1485 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165291 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 
620 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.76 
 
 
328 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  39.87 
 
 
941 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2300  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.8 
 
 
936 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.76 
 
 
828 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532868  normal  0.92327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3178  diguanylate cyclase  38.32 
 
 
452 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0366604  hitchhiker  0.0000463802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.28 
 
 
954 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1166  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 
780 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.91 
 
 
756 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.95 
 
 
862 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  29.65 
 
 
621 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1526  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.98 
 
 
504 aa  100  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0664  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.34 
 
 
307 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  38.69 
 
 
908 aa  100  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2517  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.97 
 
 
614 aa  100  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.02 
 
 
723 aa  100  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0375  hypothetical protein  38.18 
 
 
972 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.22 
 
 
884 aa  100  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.86 
 
 
882 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5789  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.2 
 
 
841 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.992809  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.38 
 
 
1289 aa  99.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1681  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.14 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.650455  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.33 
 
 
896 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4105  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.86 
 
 
882 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>