100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1757 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0553  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.853568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.75 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  23.77 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.27 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  29.82 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  27.66 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.02 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  28.14 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  28.74 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  27.32 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.44 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  28.43 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  27.1 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  26.34 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.93 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  26.34 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  27.47 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  25.82 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  25.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  25.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  25.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.01 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  24.87 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  27.27 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  23.95 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  31.06 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.63 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  24.59 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  28.4 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  24.62 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  26.63 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.42 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.29 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  27.92 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.26 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  23.61 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  24.58 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  23.98 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0883  Flp pilus assembly protein CpaB  30.67 
 
 		 432 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  23.5 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.58 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  29.29 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  25.64 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  25.11 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  21.89 
 
 		 291 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  34.95 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  30.94 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  25.67 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  23.47 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  31.13 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  28.12 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  26.42 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  23.92 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.37 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  24.79 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  23.49 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  27.43 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  24.39 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  24.26 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  24.48 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  21.2 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  30.82 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  30.82 
 
 		 342 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  25.23 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0202  hypothetical secreted protein  30.99 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  26.46 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  23.12 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  27.59 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  30.93 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  22.91 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  35.38 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  30.93 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  25.35 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  35.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  35.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  35.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  35.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1208  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.03 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000207923  decreased coverage  8.378480000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  26.14 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  34 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  21.95 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  26.16 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  26.47 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  26.47 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  22.81 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  32.14 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  54.29 
 
 		 345 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  32.46 
 
 		 319 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  25.93 
 
 		 260 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>